当前，农村集体经济组织资金往来不断增多，新农村建设也涉及大量的财政惠农资金，村级审计工作已成为强化村级财务管理不可或缺的重要一环。县审计局、乡镇财政所、农经站等均根据不同法律政策依据对农村财务开展审计，农村审计主体呈现多元化，在一些地方造成重复审计、令出多门等问题，理顺农村审计主体刻不容缓。

　　目前较为常见的农村审计形式有村集体财务收支审计、村干部任期及离任经济责任审计、各类财政专项审计等，开展审计工作的主体有乡镇农经站、财政所、县审计局委托乡镇审计。

　　在实践中，三类审计主体并存引发了一些问题。目前我国没有专门的农村审计法律，而且不同层次法律、部门法规之间存在交叉冲突，造成农村审计的法律依据不一致，严重影响政府审计的权威性和严肃性。审计主体多元化导致政府部门各自为政，互相扯皮、推诿，严重影响了审计效率，使农村审计工作者无所适从。

　　按照审计法、财政资金使用管理相关规定，财政、审计部门组织的审计是政府内部审计的延伸，主要针对国家财政资金的收支进行审计，而农村集体经济组织审计的事项不仅仅是财政资金，还包含大量的非财政资金。农村集体经济组织是一个村民集体自治组织，不是一级政府机构，也不是县乡下属单位和部门，因此村集体经济组织审计不同于通常意义上的政府内部审计。

　　农经部门是农村集体经济组织审计的主管部门。2007年农业部颁布的《农村集体经济组织审计规定》对农村集体经济组织审计作出了相应的规范。其中第三条规定，县级及以上农村经营管理部门指导农村集体经济组织的审计工作，乡级农村经营管理部门负责农村集体经济组织的审计工作。

　　要想真正理顺农村审计主体，还需从审计委托主体入手。按照《中华人民共和国村民委员会组织法》第三十五条规定，村民委员会是本村审计的委托主体，委托审计的内容既包含财政资金审计也包含非财政资金的审计。在有条件的地方，可以探索以村民委员会委托审计的方式明确审计主体，充分体现村民自治对审计的需求。